يتكون المعهد العالى للصحة العامة من عشرة أقسام ويمنح درجات الدبلوم والماجستير والدكتوراة في الصحة العامة للأطباء وعلوم الصحة العامة لغير الأطباء:
1- قسم الوبائيات
2- قسم الأحصاءات الحيوية
3- قسم صحة المناطق الحارة والطفيليات:
4- قسم الأحياء الدقيقة
5- قسم الصحة المهنية وطب الصناعات
6- قسم صحة البيئة
7- قسم التغذيـة ويشمل تخصصات:
أ- التغذيــــــــة ب- تحليل الأغذيــــة
8- قسم الإدارة الصحية والعلوم السلوكية ويشمل تخصصات:
أ- الإدارة والتخطيط والسياسة الصحية ب- إدارة المستشفيات
ج- التثقيف الصحى والعلوم السلوكية
9- قسم صحة الأسرة ويشمل تخصصات:
أ-صحة الأم والطفل ب- الصحة المدرسية وصحة المراهق
ج- الصحة النفسيــــــة د- صحة المسنين
هـ- تمريض الصحة العامـة
10- قسم الرعاية الصحية الأولية